Unterschiede
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hlr:phoenix:nutzeranleitung [2020/11/30 18:50] tarkhell [Jobfile] |
hlr:phoenix:nutzeranleitung [2021/12/16 11:00] matfranz [Jobfile] |
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| - | Ein Beispiel für ein Jobfile für einen GPU-Knoten sieht wie folgt aus: | + | Es gibt insgesamt acht GPU-Konten mit jeweils vier Grafikkarten. Für diese gibt es drei verschiedene GPU queues mit verschiedenen Workloads: |
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| + | <code>Â | ||
| + | gpu01_queue: 2 GPU-Knoten, hohe Priorität; nur für Jobs, die alle vier GPUs eines Knotens allozieren; maximal ein Job pro User; Walltime: 3 Tage | ||
| + | gpu02_queue: 6 GPU-Knoten, hohe Priorität; auch für Jobs, die nur einzelne GPUs allozieren; maximal zwei Jobs pro User; Walltime: 7 Tage | ||
| + | gpu03_queue: 8 GPU-Knoten, niedrige Priorität; auch für Jobs, die nur einzelne GPUs allozieren; Anzahl der Jobs pro User unbegrenzt; Walltime: 7 Tage; Jobs können unterbrochen werden, daher Checkpoints im Code verwenden | ||
| + | </code>Â | ||
| + | Â | ||
| + | Ein Beispiel für ein Jobfile für einen der GPU-Knoten sieht wie folgt aus: | ||
| <code> | <code> | ||
| #!/bin/bash -l | #!/bin/bash -l | ||
| - | #SBATCH --partition=gpu | + | #SBATCH --partition=gpu02_queue |
| #SBATCH --nodes=2 | #SBATCH --nodes=2 | ||
| #SBATCH --time=2-00:00:00 | #SBATCH --time=2-00:00:00 | ||
| - | #SBATCH --job-name=TrainDenoiseModel | + | #SBATCH --job-name=GPUExample |
| #SBATCH --ntasks-per-node=4 | #SBATCH --ntasks-per-node=4 | ||
| #SBATCH --gres=gpu:4 | #SBATCH --gres=gpu:4 | ||
| ~/anaconda3/bin/python "/path/to/file/example.py" | ~/anaconda3/bin/python "/path/to/file/example.py" | ||
| - | </code | + | </code> |
| Weitere Informationen bietet auch ''man sbatch''. Sämtliche dort verwendeten Parameter können auch im Jobscript selber mit ''#SBATCH'' angeben werden. | Weitere Informationen bietet auch ''man sbatch''. Sämtliche dort verwendeten Parameter können auch im Jobscript selber mit ''#SBATCH'' angeben werden. | ||
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| --begin=now+60 (seconds by default) | --begin=now+60 (seconds by default) | ||
| --begin=2010-01-20T12:34:00 | --begin=2010-01-20T12:34:00 | ||
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| + | In the following you can find an example for a jobfile for a GPU-node: | ||
| + | |||
| + | <code> | ||
| + | #!/bin/bash -l | ||
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| + | #SBATCH --partition=gpu | ||
| + | #SBATCH --nodes=2 | ||
| + | #SBATCH --time=2-00:00:00 | ||
| + | #SBATCH --job-name=GPUExample | ||
| + | #SBATCH --ntasks-per-node=4 | ||
| + | #SBATCH --gres=gpu:4 | ||
| + | |||
| + | ~/anaconda3/bin/python "/path/to/file/example.py" | ||
| </code> | </code> | ||
