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hlr:phoenix:nutzeranleitung [2020/05/05 12:24] raskrato |
hlr:phoenix:nutzeranleitung [2020/05/05 12:25] raskrato [Lehre] |
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| Für die Lehre existiert eine Queue: teaching und in Zukunft teaching_gpu. Diese Knoten verfügen nicht über eine funktionierende Infinity Band Verbindung sondern nutzen klassisches Ethernet für die MPI Kommunikation. Daher muss in der Jobfile angegeben werden, dass Ethernet genutzt werden soll. | Für die Lehre existiert eine Queue: teaching und in Zukunft teaching_gpu. Diese Knoten verfügen nicht über eine funktionierende Infinity Band Verbindung sondern nutzen klassisches Ethernet für die MPI Kommunikation. Daher muss in der Jobfile angegeben werden, dass Ethernet genutzt werden soll. | ||
| - | <note>NUMBER_OF_CPU_CORES_TO_USE=16 | + | <code>NUMBER_OF_CPU_CORES_TO_USE=16 |
| mpirun -n $NUMBER_OF_CPU_CORES_TO_USE --mca btl tcp,sm,self --mca btl_tcp_if_include eth0 /home/your_name/your_binary | mpirun -n $NUMBER_OF_CPU_CORES_TO_USE --mca btl tcp,sm,self --mca btl_tcp_if_include eth0 /home/your_name/your_binary | ||
| - | </note> | + | </code> |
| Beispiel Jobfile: | Beispiel Jobfile: | ||
| - | <note>#!/bin/bash -l | + | <code>#!/bin/bash -l |
| #SBATCH --partition=visalt | #SBATCH --partition=visalt | ||
| Zeile 396: | Zeile 396: | ||
| module load mpi/openmpi/2.1.0/gcc comp/gcc/6.3.0 | module load mpi/openmpi/2.1.0/gcc comp/gcc/6.3.0 | ||
| - | mpirun -n 16 --mca btl tcp,sm,self --mca btl_tcp_if_include eth0 /home/raskrato/alt/visalt/ptest</note> | + | mpirun -n 16 --mca btl tcp,sm,self --mca btl_tcp_if_include eth0 /home/raskrato/alt/visalt/ptest</code> |
